Główne zaplecze badawcze ZFCS tworzy laboratorium epitaksji HgCdTe ze związków metaloorganicznych (MOCVD), laboratorium epitaksji materiałów AIIIBV z wiązek molekularnych (MBE), laboratorium processingu, które obejmuje pracownię fotolitograficzną, chemiczną oraz laboratorium próżniowe wyposażone w stanowiska do otrzymywania warstw dielektrycznych oraz metalicznych, a także laboratorium charakteryzacji umożliwiające wykonywanie pomiarów optycznych i elektrycznych wytworzonych struktur oraz przyrządów detekcyjnych.